公司因此扣发3008人工资，法律上允许吗？

公司扣发工资需有合法依据，否则违法。依据《劳动法》，工资应按时足额支付，无故扣发可投诉或仲裁。不及时处理，可能影响员工权益及公司声誉。
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公司扣工资违法。操作：1.与公司沟通，要求说明扣发理由；2.若沟通无果，向劳动监察大队投诉，提供工资单等证据；3.若问题未解决，申请劳动仲裁，提交相关证据材料；4.对仲裁结果不服，可向法院提起诉讼。
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处理此事可投诉劳动监察或申请劳动仲裁。选择时，若希望快速解决且保持工作关系，可先尝试与公司沟通；若沟通无果，则向劳动监察大队投诉；若问题严重，直接申请劳动仲裁。